MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014002	CAG	2	6	355476	355481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495022
6002	NC_014002	CTT	2	6	355482	355487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495022
6003	NC_014002	TA	3	6	355507	355512	50 %	50 %	0 %	0 %	294495022
6004	NC_014002	TCT	2	6	355583	355588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495022
6005	NC_014002	ATC	2	6	355618	355623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495022
6006	NC_014002	ATC	2	6	355645	355650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495022
6007	NC_014002	TTC	2	6	355714	355719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495022
6008	NC_014002	TGCT	2	8	355764	355771	0 %	50 %	25 %	25 %	294495022
6009	NC_014002	ATCAAC	2	12	355903	355914	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294495022
6010	NC_014002	CCA	2	6	355979	355984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495022
6011	NC_014002	AGT	2	6	355995	356000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495022
6012	NC_014002	ATT	2	6	356086	356091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495022
6013	NC_014002	TGT	2	6	356140	356145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495022
6014	NC_014002	T	6	6	356187	356192	0 %	100 %	0 %	0 %	294495022
6015	NC_014002	CAT	2	6	356214	356219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495022
6016	NC_014002	CTG	2	6	356239	356244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495022
6017	NC_014002	GCA	2	6	356255	356260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495022
6018	NC_014002	TAA	2	6	356275	356280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495022
6019	NC_014002	CTA	2	6	356286	356291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495022
6020	NC_014002	TATT	2	8	356303	356310	25 %	75 %	0 %	0 %	294495022
6021	NC_014002	CT	3	6	356461	356466	0 %	50 %	0 %	50 %	294495023
6022	NC_014002	AGA	2	6	356755	356760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495023
6023	NC_014002	GATAA	2	10	356771	356780	60 %	20 %	20 %	0 %	294495023
6024	NC_014002	AAGG	2	8	356784	356791	50 %	0 %	50 %	0 %	294495023
6025	NC_014002	TAT	2	6	356876	356881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495023
6026	NC_014002	GCA	2	6	356892	356897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495023
6027	NC_014002	AAGC	2	8	356983	356990	50 %	0 %	25 %	25 %	294495023
6028	NC_014002	CAACA	2	10	357032	357041	60 %	0 %	0 %	40 %	294495023
6029	NC_014002	AAC	2	6	357042	357047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495023
6030	NC_014002	A	6	6	357089	357094	100 %	0 %	0 %	0 %	294495023
6031	NC_014002	CGC	2	6	357103	357108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495023
6032	NC_014002	ACA	2	6	357165	357170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495023
6033	NC_014002	CCT	2	6	357207	357212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495024
6034	NC_014002	TTC	2	6	357220	357225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495024
6035	NC_014002	GCA	2	6	357245	357250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495024
6036	NC_014002	ATG	2	6	357386	357391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495024
6037	NC_014002	CAT	2	6	357432	357437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495024
6038	NC_014002	GGA	2	6	357487	357492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495024
6039	NC_014002	CGGGT	2	10	357553	357562	0 %	20 %	60 %	20 %	294495024
6040	NC_014002	TTC	2	6	357655	357660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495024
6041	NC_014002	TCA	2	6	357693	357698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495024
6042	NC_014002	CTG	2	6	357895	357900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495024
6043	NC_014002	CTG	2	6	357969	357974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495024
6044	NC_014002	TC	3	6	357985	357990	0 %	50 %	0 %	50 %	294495024
6045	NC_014002	TG	3	6	358047	358052	0 %	50 %	50 %	0 %	294495024
6046	NC_014002	ACCGGA	2	12	358210	358221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495024
6047	NC_014002	TTG	2	6	358298	358303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495024
6048	NC_014002	CTT	2	6	358326	358331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495024
6049	NC_014002	AAGA	2	8	358725	358732	75 %	0 %	25 %	0 %	294495025
6050	NC_014002	CTA	2	6	358747	358752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495025
6051	NC_014002	TCT	2	6	358754	358759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495025
6052	NC_014002	T	6	6	358763	358768	0 %	100 %	0 %	0 %	294495025
6053	NC_014002	TCT	2	6	358884	358889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495025
6054	NC_014002	TTG	2	6	359002	359007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495025
6055	NC_014002	ATT	2	6	359063	359068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495025
6056	NC_014002	GAA	2	6	359083	359088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495025
6057	NC_014002	CTG	2	6	359115	359120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495025
6058	NC_014002	TCCGAA	2	12	359166	359177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294495025
6059	NC_014002	T	6	6	359216	359221	0 %	100 %	0 %	0 %	294495025
6060	NC_014002	ATGG	2	8	359226	359233	25 %	25 %	50 %	0 %	294495025
6061	NC_014002	CAT	2	6	359339	359344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495025
6062	NC_014002	ATA	2	6	359359	359364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495025
6063	NC_014002	A	6	6	359424	359429	100 %	0 %	0 %	0 %	294495025
6064	NC_014002	CTGG	2	8	359453	359460	0 %	25 %	50 %	25 %	294495025
6065	NC_014002	TCC	2	6	359485	359490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495025
6066	NC_014002	CTG	2	6	359497	359502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495025
6067	NC_014002	CAACC	2	10	359544	359553	40 %	0 %	0 %	60 %	294495025
6068	NC_014002	ATG	2	6	359617	359622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495025
6069	NC_014002	T	6	6	359643	359648	0 %	100 %	0 %	0 %	294495025
6070	NC_014002	GAT	2	6	359712	359717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495025
6071	NC_014002	CT	3	6	359782	359787	0 %	50 %	0 %	50 %	294495025
6072	NC_014002	A	6	6	359817	359822	100 %	0 %	0 %	0 %	294495025
6073	NC_014002	CAA	2	6	359849	359854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495025
6074	NC_014002	ATG	2	6	359909	359914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495025
6075	NC_014002	G	6	6	359946	359951	0 %	0 %	100 %	0 %	294495026
6076	NC_014002	GA	3	6	359964	359969	50 %	0 %	50 %	0 %	294495026
6077	NC_014002	TGA	2	6	360033	360038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495026
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6080	NC_014002	CA	3	6	360122	360127	50 %	0 %	0 %	50 %	294495026
6081	NC_014002	GAT	2	6	360229	360234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495026
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6088	NC_014002	GT	3	6	360580	360585	0 %	50 %	50 %	0 %	294495026
6089	NC_014002	AGAA	2	8	360682	360689	75 %	0 %	25 %	0 %	294495026
6090	NC_014002	GTT	2	6	360735	360740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495026
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6092	NC_014002	AGA	2	6	360786	360791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495026
6093	NC_014002	CAA	2	6	360877	360882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495026
6094	NC_014002	AAT	2	6	360916	360921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495026
6095	NC_014002	CAG	2	6	360935	360940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495026
6096	NC_014002	TA	3	6	360961	360966	50 %	50 %	0 %	0 %	294495026
6097	NC_014002	ATT	2	6	360989	360994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495026
6098	NC_014002	ATG	2	6	361100	361105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495026
6099	NC_014002	TGA	2	6	361182	361187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495026
6100	NC_014002	CCGA	2	8	361219	361226	25 %	0 %	25 %	50 %	294495026
6101	NC_014002	TA	3	6	361228	361233	50 %	50 %	0 %	0 %	294495026
6102	NC_014002	AAT	2	6	361234	361239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495026
6103	NC_014002	TGA	2	6	361271	361276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495026
6104	NC_014002	TGA	2	6	361350	361355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495026
6105	NC_014002	CGTAT	2	10	361399	361408	20 %	40 %	20 %	20 %	294495026
6106	NC_014002	GCA	2	6	361423	361428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495026
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6109	NC_014002	TC	3	6	361533	361538	0 %	50 %	0 %	50 %	294495026
6110	NC_014002	A	6	6	361583	361588	100 %	0 %	0 %	0 %	294495026
6111	NC_014002	GAT	2	6	361614	361619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495026
6112	NC_014002	TG	3	6	361672	361677	0 %	50 %	50 %	0 %	294495026
6113	NC_014002	T	6	6	361784	361789	0 %	100 %	0 %	0 %	294495027
6114	NC_014002	AGTCCG	2	12	361799	361810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294495027
6115	NC_014002	CTGA	2	8	361823	361830	25 %	25 %	25 %	25 %	294495027
6116	NC_014002	T	6	6	361867	361872	0 %	100 %	0 %	0 %	294495027
6117	NC_014002	ATC	2	6	361873	361878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495027
6118	NC_014002	CTCCCT	2	12	361884	361895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495027
6119	NC_014002	TAT	2	6	361933	361938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495027
6120	NC_014002	GATT	2	8	362011	362018	25 %	50 %	25 %	0 %	294495027
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6122	NC_014002	GATC	2	8	362061	362068	25 %	25 %	25 %	25 %	294495027
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6131	NC_014002	T	6	6	362394	362399	0 %	100 %	0 %	0 %	294495027
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6246	NC_014002	ATG	2	6	368621	368626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495037
6247	NC_014002	ATGG	2	8	368642	368649	25 %	25 %	50 %	0 %	294495037
6248	NC_014002	CTGC	2	8	368714	368721	0 %	25 %	25 %	50 %	294495037
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6490	NC_014002	TTG	2	6	381790	381795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495048
6491	NC_014002	ATC	2	6	381833	381838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495048
6492	NC_014002	CAT	2	6	381884	381889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495048
6493	NC_014002	TGG	2	6	381919	381924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495048
6494	NC_014002	A	6	6	381960	381965	100 %	0 %	0 %	0 %	294495048
6495	NC_014002	TGA	2	6	381968	381973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495048
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6498	NC_014002	TTAA	2	8	382012	382019	50 %	50 %	0 %	0 %	294495048
6499	NC_014002	TTTA	2	8	382089	382096	25 %	75 %	0 %	0 %	294495049
6500	NC_014002	TC	3	6	382153	382158	0 %	50 %	0 %	50 %	294495049

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